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InDraw for Excel > 功能介紹
InDraw for Excel
在Excel中快速創(chuàng)建、搜索、共享化學(xué)數(shù)據(jù)庫
Conversion
Get Structure-From Name
選中Excel某列,此列的單元格的內(nèi)容為Name,選擇Get Structure-From Name,可批量生成化學(xué)結(jié)構(gòu)式
Get Structure-From SMILES
選中Excel某列,此列的單元格的內(nèi)容為SMILES,選擇Get Structure-From SMILES,可批量生成化學(xué)結(jié)構(gòu)式
Get Structure-From InChI
選中Excel某列,此列的單元格的內(nèi)容為InChI,選擇Get Structure-From InChI,可批量生成化學(xué)結(jié)構(gòu)式
Get Structure: 批量在Excel中生成化學(xué)結(jié)構(gòu)式
SDF
Import SDF
導(dǎo)入SDF文件。瀏覽選擇.sdf格式的文件,直接導(dǎo)入,即可在Excel中瀏覽sdf文件的所有內(nèi)容。為了壓縮文件大小,增加文件的可讀書性,導(dǎo)入時(shí),InDraw for Excel自動將SDF中的標(biāo)準(zhǔn)結(jié)構(gòu)式文件Molfile轉(zhuǎn)化成體積更小的SMILES。如用戶需要Molfile,可以將SMILES文件再轉(zhuǎn)化為Molfile。
Export SDF
可以將批量的SMILES文件,轉(zhuǎn)化為SDF文件。如您只有Molfile,可先將Molfile轉(zhuǎn)化成SMILES后,再執(zhí)行Export SDF。

結(jié)構(gòu)式搜索是化學(xué)信息快速獲取的重要手段,InDraw for Excel突破性地在Excel中實(shí)現(xiàn)子結(jié)構(gòu)搜索、精確結(jié)構(gòu)式搜索、相似度計(jì)算和搜索,通過Tanimoto算法,計(jì)算出相似度數(shù)值。可適用于用Excel管理的化學(xué)試劑庫存快捷實(shí)現(xiàn)結(jié)構(gòu)式搜索(PS: 結(jié)構(gòu)式數(shù)據(jù)可從英文名稱迅速轉(zhuǎn)化成SMILES,快速獲得),也可適用于沒有化合物管理系統(tǒng)的小團(tuán)隊(duì),進(jìn)行簡單的化合物管理(通過精確結(jié)構(gòu)式搜索,手動編寫唯一編號,輔之以更多屬性數(shù)值,進(jìn)行簡化化合物管理。推薦與鷹谷開發(fā)的InCMS結(jié)合一起使用。)

為了避免重復(fù)畫結(jié)構(gòu),可以從“Structure form history”中找到歷史輸入的結(jié)構(gòu),直接進(jìn)行再次搜索。

用上面的結(jié)構(gòu)進(jìn)行相似度計(jì)算,得到如下結(jié)果:

Copy

Copy as-SMILES

選中一個(gè)單元格,其中內(nèi)容為Molfie或InChI,選擇Copy as-SMILES,則在剪貼板中獲得一個(gè)SMILES單行字符串,可以直接粘貼(ctrl v)到一個(gè)word文檔或單元格中

Copy as-Molfie

選中一個(gè)單元格,其中內(nèi)容為SMILES或InChI,選擇Copy as-Molfie,則在剪貼板中獲得一個(gè)Molfile多行文本,可以直接粘貼(ctrl v)到一個(gè)word文檔或單元格中

Copy as-InChI

選中一個(gè)單元格,其中內(nèi)容為Molfie或SMILES,選擇Copy as-InChI,則在剪貼板中獲得一個(gè)InChI單行字符串,可以直接粘貼(ctrl v)到一個(gè)word文檔或單元格中

Chemistry

選中Excel中的一列SMILES或InChI(僅支持SMILES和InChI,如果是Molfile,可先轉(zhuǎn)化為SMILES后,再進(jìn)行計(jì)算);選擇Computation-MF,即可批量計(jì)算出分子式

Computation-MW:計(jì)算分子量

選中Excel中的一列SMILES或InChI(僅支持SMILES和InChI,如果是Molfile,可先轉(zhuǎn)化為SMILES后,再進(jìn)行計(jì)算);選擇Computation-MW,即可批量計(jì)算出分子量

Computation-cLogP:計(jì)算cLogP脂水分布系數(shù)

選中Excel中的一列SMILES或InChI(僅支持SMILES和InChI,如果是Molfile,可先轉(zhuǎn)化為SMILES后,再進(jìn)行計(jì)算);選擇Computation- cLogP,即可批量計(jì)算出cLogP,對“Linpiski’s rule of five” Linpiski口服藥五原則非常重視的藥物化學(xué)家,將非常喜歡這個(gè)功能

Computation-tPSA:計(jì)算tPSA(拓?fù)錁O性表面積)

選中Excel中的一列SMILES或InChI(僅支持SMILES和InChI,如果是Molfile,可先轉(zhuǎn)化為SMILES后,再進(jìn)行計(jì)算);選擇Computation-tPSA,即可批量計(jì)算出tPSA

Computation-Heavy atom:計(jì)算重原子數(shù)量

選中Excel中的一列SMILES或InChI(僅支持SMILES和InChI,如果是Molfile,可先轉(zhuǎn)化為SMILES后,再進(jìn)行計(jì)算);選擇Computation-Heavy atom,即可批量計(jì)算出Heavy atom數(shù)量。

Computation-H Donors:計(jì)算H供體數(shù)量

選中Excel中的一列SMILES或InChI(僅支持SMILES和InChI,如果是Molfile,可先轉(zhuǎn)化為SMILES后,再進(jìn)行計(jì)算);選擇Computation-H Donors,即可批量計(jì)算出H Donors數(shù)量

Computation-H Acceptors:計(jì)算H Acceptors(H受體)數(shù)量

選中Excel中的一列SMILES或InChI(僅支持SMILES和InChI,如果是Molfile,可先轉(zhuǎn)化為SMILES后,再進(jìn)行計(jì)算);選擇Computation-H Acceptors,即可批量計(jì)算出H Acceptors數(shù)量

Computation-Heteroatoms:計(jì)算Heteroatoms(雜原子)數(shù)量

選中Excel中的一列SMILES或InChI(僅支持SMILES和InChI,如果是Molfile,可先轉(zhuǎn)化為SMILES后,再進(jìn)行計(jì)算);選擇Computation- Heteroatoms,即可批量計(jì)算出Heteroatoms數(shù)量

Computation-Hydrogens:計(jì)算Hydrogens(H原子)數(shù)量

選中Excel中的一列SMILES或InChI(僅支持SMILES和InChI,如果是Molfile,可先轉(zhuǎn)化為SMILES后,再進(jìn)行計(jì)算);選擇Computation-Hydrogens,即可批量計(jì)算出H原子數(shù)量

致謝:InDraw for Excel的計(jì)算基于知名的RDKit整合開發(fā)而成,性能獲得優(yōu)化提升,更多詳情參考RDKit官網(wǎng)。